提取组织中DNA时蛋白酶K配置方法

DNA 的提取

酚-氯仿提取法

取液氮冷冻的叶片2-3片, 在液氮冷冻下迅速研磨成粉末。

将粉末放入到1.5 ml离心管中,然后加入缓冲液“S”750ul, 充分混匀。

将离心管置于65℃水浴中1-2小时,水浴过程中温和混匀几次。

取出离心管, 每管加入等体积的酚-氯仿(V/V=1:1)溶液600-700ul,混匀后离心,10000rpm, 10分钟。

上清液移入另一离心管中,加入等体积的氯仿,混匀后,10000rpm, 6分钟。

将上清液移入另一离心管中,加入0.6倍体积的异丙醇,轻轻混匀,静置一段时间,然后用枪头勾出DNA,并用70%乙醇冲洗2次。

勾出的DNA,真空干燥后将其溶于500ul 1x TE中。

加入3ul RNA 酶溶液,37℃保温1 小时。
加入等体积的酚-氯仿溶液, 轻轻混匀后, 10000rpm离心6分钟。

取上清液,加入等体积的氯仿,轻轻混匀后,10000rpm离心6分钟。

取上清液,入1/10体积3M醋酸钠,混匀后,加入2倍体积冷的无水乙醇(或95%乙醇)。

轻轻混匀静置一会儿后,用枪头勾出DNA, 用70%乙醇冲洗2次后,真空干燥。

依所提DNA量加入20-50ul的1x TE溶解DNA。

测定DNA 的浓度,取少量样品跑电泳, Agarose 胶的浓度为0.8%。

样品在4℃下保存备用。

附: 提DNA 所用试剂配方:

1. 1M Tris.Cl

1L:800ml H2O中加121.1g Tris, 用HCl调pH 至8.5后定溶至1升, 灭菌。

2. 0.5M EDTA pH8

1L: 800ml H2O中加186.1g EDTANa2 2H2O,用NaOH调 pH至8.0,定溶至 1 升。

3. 20% SDS

2L: 在2L热水中缓慢加 400g SDS, 边加边搅拌,溶解后放置热地方保存。

4. 5M NaCl

1L: 750ml H2O中加292.2g NaCl,溶解后定溶至1升, 灭菌。

5. 缓冲液“S” 配1L缓冲液“S”

100mM Tris.Cl pH8.5 1M Tris.Cl 100ml

100mM NaCl 5M NaCl 20ml

50mM EDTA pH8.0 0.5M EDTA 100ml

2% SDS 20% SDS 100ml

H2O 680ml

6. 100x TE

1L: 800ml H2O中加121.1g Tris, 37.2 EDTA Na2 2H2O, 用HCl调 pH至8.0, 定溶, 灭菌。

7. 50x TAE

1L: 500ml H2O中加242g Tris,溶解后加100ml 0.5M EDTA pH8.0和57.1ml冰醋酸,定溶。

8. 蛋白酶K溶液的配制

用20mMTris.Cl, pH8, 2mMCaCl2的缓冲液配制浓度为10ug/ul 的蛋白酶K溶液; 或用超纯水配制成相同的浓度。

9. RNase (去DNA酶的RNA酶)

用水溶解RNase, 终浓度10mg/ml, 煮沸20分钟,缓慢冷却, 分装,-20℃下 保存。

10. 3M NaAc pH5.2

1L: 600ml H2O中加入408.24gNaAc 3H2O , 溶解后,用冰醋酸调pH至5.2, 然 后定溶1L ,灭菌,